ตามที่ประเทศญี่ปุ่นได้ประสบอุทกภัยและภาวะดินถล่มจากเหตุการณ์ฝนตกหนักเป็นประวัติการณ์ในพื้นที่ ๒๓ จังหวัดทางฝั่งตะวันตก ตั้งแต่วันที่ ๕ กรกฎาคม ๒๕๖๑ ส่งผลให้มีผู้เสียชีวิตแล้ว ๒๑๐ ราย สูญหาย ๒๒ ราย โดย ๔,๘๐๐ รายยังคงอาศัยอยู่ที่ศูนย์พักพิงชั่วคราวใน ๑๔ จังหวัด และประมาณ ๑๖๒,๐๐๐ ครัวเรือนยังคงไม่มีน้ำประปาใช้ (สถานะ ณ วันที่ ๑๕ กรกฎาคม ๒๕๖๑ เวลา ๒๑.๐๐ น. ตามเวลาท้องถิ่น) โดยนายกรัฐมนตรีได้มีสารแสดงความเสียใจถึงนายกรัฐมนตรีญี่ปุ่นแล้วเมื่อวันที่ ๑๒ กรกฎาคม ๒๕๖๑ อีกทั้งนายสมคิด จาตุศรีพิทักษ์ รองนายกรัฐมนตรี ได้มีข้อความสารแสดงความเสียใจถึงนายโยะชิฮิเดะ สึกะ เลขาธิการคณะรัฐมนตรีญี่ปุ่น และรัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศได้มีข้อความสารแสดงความเสียใจถึงรัฐมนตรีว่าการกระทรวงการต่างประเทศญี่ปุ่นด้วยแล้ว นั้น

เมื่อวันที่ ๑๖ กรกฎาคม ๒๕๖๑ เวลา ๐๙.๐๐ น. นายกรัฐมนตรีได้มอบเงินช่วยเหลือเป็นเงิน ๕ ล้านบาท หรือมากกว่า ๑๖ ล้านเยน ให้แก่นายชิโระ ซะโดะชิมะ เอกอัครราชทูตญี่ปุ่นประจำประเทศไทย ณ ห้องสีม่วง ตึกไทยคู่ฟ้า ทำเนียบรัฐบาล เพื่อเป็นการแสดงความห่วงใยและน้ำใจของประเทศไทยต่อเหตุการณ์ครั้งนี้